整合信息理论能够提供对意识水平和意识体验的定量预测，但由于对于复杂系统的计算难度过大，使得针对最新版本理论的实验验证较为匮乏。进行更可信的对整合信息理论的实验检验是该理论最迫切的挑战。
整合信息理论还应当注重与其它意识理论的结合。现在的整合信息理论难以解释认知科学所关心的信息处理问题，同时也被认为属于少数不承认计算功能主义（Computational functionalism）的理论[120]。为了进一步发展理论，整合信息理论应当回应认知科学界的质疑。
整合信息理论的理论基础建设也应当有更系统的发展。自由能原理的理论发展或许可以成为进一步构建整合信息理论的参考[121]。